Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms