Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD9

FARSB, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSBQ9NSD9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARSBQ9NSD9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms