Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOMER3Q9NSC5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms