Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAPOLBQ9NRJ5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAPOLBQ9NRJ5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAPOLBQ9NRJ5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAPOLBQ9NRJ5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAPOLBQ9NRJ5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAPOLBQ9NRJ5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAPOLBQ9NRJ5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAPOLBQ9NRJ5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAPOLBQ9NRJ5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAPOLBQ9NRJ5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAPOLBQ9NRJ5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAPOLBQ9NRJ5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAPOLBQ9NRJ5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAPOLBQ9NRJ5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAPOLBQ9NRJ5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAPOLBQ9NRJ5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PAPOLBQ9NRJ5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PAPOLBQ9NRJ5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PAPOLBQ9NRJ5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PAPOLBQ9NRJ5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PAPOLBQ9NRJ5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PAPOLBQ9NRJ5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PAPOLBQ9NRJ5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PAPOLBQ9NRJ5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms