Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ3

CCL28, C-C motif chemokine 28, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28Q9NRJ3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms