Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
DUOX2Q9NRD8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC31.12■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
DUOX2Q9NRD8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms