Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX9Q9NQ69 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms