Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IL1RAPQ9NPH3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IL1RAPQ9NPH3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IL1RAPQ9NPH3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IL1RAPQ9NPH3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IL1RAPQ9NPH3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IL1RAPQ9NPH3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
IL1RAPQ9NPH3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IL1RAPQ9NPH3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IL1RAPQ9NPH3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IL1RAPQ9NPH3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IL1RAPQ9NPH3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IL1RAPQ9NPH3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IL1RAPQ9NPH3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IL1RAPQ9NPH3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IL1RAPQ9NPH3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IL1RAPQ9NPH3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IL1RAPQ9NPH3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IL1RAPQ9NPH3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IL1RAPQ9NPH3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IL1RAPQ9NPH3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IL1RAPQ9NPH3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IL1RAPQ9NPH3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IL1RAPQ9NPH3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IL1RAPQ9NPH3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
IL1RAPQ9NPH3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IL1RAPQ9NPH3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IL1RAPQ9NPH3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IL1RAPQ9NPH3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IL1RAPQ9NPH3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IL1RAPQ9NPH3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IL1RAPQ9NPH3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IL1RAPQ9NPH3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IL1RAPQ9NPH3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IL1RAPQ9NPH3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IL1RAPQ9NPH3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IL1RAPQ9NPH3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IL1RAPQ9NPH3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
IL1RAPQ9NPH3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
IL1RAPQ9NPH3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IL1RAPQ9NPH3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IL1RAPQ9NPH3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IL1RAPQ9NPH3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IL1RAPQ9NPH3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms