Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
A4GALTQ9NPC4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
A4GALTQ9NPC4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
A4GALTQ9NPC4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
A4GALTQ9NPC4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
A4GALTQ9NPC4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
A4GALTQ9NPC4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
A4GALTQ9NPC4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
A4GALTQ9NPC4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
A4GALTQ9NPC4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
A4GALTQ9NPC4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
A4GALTQ9NPC4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
A4GALTQ9NPC4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
A4GALTQ9NPC4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
A4GALTQ9NPC4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
A4GALTQ9NPC4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
A4GALTQ9NPC4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
A4GALTQ9NPC4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
A4GALTQ9NPC4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
A4GALTQ9NPC4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
A4GALTQ9NPC4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
A4GALTQ9NPC4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
A4GALTQ9NPC4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
A4GALTQ9NPC4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
A4GALTQ9NPC4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
A4GALTQ9NPC4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
A4GALTQ9NPC4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
A4GALTQ9NPC4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms