Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms