Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYP4F12Q9HCS2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms