Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LY9Q9HBG7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LY9Q9HBG7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LY9Q9HBG7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LY9Q9HBG7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LY9Q9HBG7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LY9Q9HBG7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LY9Q9HBG7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LY9Q9HBG7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LY9Q9HBG7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LY9Q9HBG7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LY9Q9HBG7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LY9Q9HBG7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LY9Q9HBG7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LY9Q9HBG7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LY9Q9HBG7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LY9Q9HBG7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LY9Q9HBG7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LY9Q9HBG7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LY9Q9HBG7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LY9Q9HBG7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LY9Q9HBG7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LY9Q9HBG7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LY9Q9HBG7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LY9Q9HBG7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LY9Q9HBG7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LY9Q9HBG7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LY9Q9HBG7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LY9Q9HBG7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LY9Q9HBG7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LY9Q9HBG7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms