Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMYD3Q9H7B4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms