Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6K4

OPA3, Optic atrophy 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPA3Q9H6K4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
OPA3Q9H6K4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms