Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC4Q9H6D8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms