Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W2

MIXL1, Homeobox protein MIXL1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIXL1Q9H2W2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MIXL1Q9H2W2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIXL1Q9H2W2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIXL1Q9H2W2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIXL1Q9H2W2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIXL1Q9H2W2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIXL1Q9H2W2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MIXL1Q9H2W2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIXL1Q9H2W2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIXL1Q9H2W2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIXL1Q9H2W2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIXL1Q9H2W2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIXL1Q9H2W2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIXL1Q9H2W2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIXL1Q9H2W2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIXL1Q9H2W2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIXL1Q9H2W2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MIXL1Q9H2W2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MIXL1Q9H2W2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MIXL1Q9H2W2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MIXL1Q9H2W2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MIXL1Q9H2W2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MIXL1Q9H2W2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MIXL1Q9H2W2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MIXL1Q9H2W2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MIXL1Q9H2W2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MIXL1Q9H2W2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MIXL1Q9H2W2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MIXL1Q9H2W2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms