Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms