Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRIM31Q9BZY9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms