Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms