Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CARD11Q9BXL7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CARD11Q9BXL7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms