Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VN1R3Q9BXE9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VN1R3Q9BXE9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms