Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms