Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SHANK2-AS3Q9BTD1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms