Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CRACR2AQ9BSW2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRACR2AQ9BSW2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms