Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM2D3Q9BRN9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms