Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC77Q9BR77 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC77Q9BR77 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms