Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
EBF4Q9BQW3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms