Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BPIFA3Q9BQP9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms