Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOL4Q9BPW4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms