Protein–RNA interactions for Protein: Q99988

GDF15, Growth/differentiation factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF15Q99988 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GDF15Q99988 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDF15Q99988 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms