Protein–RNA interactions for Protein: Q99816

TSG101, Tumor susceptibility gene 101 protein, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101Q99816 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSG101Q99816 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSG101Q99816 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms