Protein–RNA interactions for Protein: Q99766

ATP5S, ATP synthase subunit s, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5SQ99766 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5SQ99766 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms