Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms