Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP4Q99569 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP4Q99569 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP4Q99569 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP4Q99569 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP4Q99569 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP4Q99569 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKP4Q99569 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP4Q99569 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP4Q99569 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP4Q99569 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP4Q99569 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP4Q99569 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP4Q99569 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP4Q99569 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP4Q99569 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP4Q99569 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP4Q99569 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP4Q99569 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP4Q99569 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP4Q99569 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP4Q99569 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP4Q99569 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP4Q99569 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP4Q99569 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PKP4Q99569 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKP4Q99569 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKP4Q99569 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKP4Q99569 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKP4Q99569 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKP4Q99569 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKP4Q99569 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKP4Q99569 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKP4Q99569 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PKP4Q99569 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKP4Q99569 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PKP4Q99569 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PKP4Q99569 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PKP4Q99569 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PKP4Q99569 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms