Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
MMP19Q99542 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MMP19Q99542 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms