Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EYA3Q99504 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms