Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC38A2Q96QD8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC38A2Q96QD8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC38A2Q96QD8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC38A2Q96QD8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC38A2Q96QD8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC38A2Q96QD8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC38A2Q96QD8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC38A2Q96QD8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC38A2Q96QD8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC38A2Q96QD8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC38A2Q96QD8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC38A2Q96QD8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC38A2Q96QD8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC38A2Q96QD8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC38A2Q96QD8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC38A2Q96QD8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC38A2Q96QD8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC38A2Q96QD8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC38A2Q96QD8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC38A2Q96QD8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC38A2Q96QD8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC38A2Q96QD8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC38A2Q96QD8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC38A2Q96QD8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC38A2Q96QD8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC38A2Q96QD8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC38A2Q96QD8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC38A2Q96QD8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC38A2Q96QD8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC38A2Q96QD8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC38A2Q96QD8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC38A2Q96QD8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC38A2Q96QD8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC38A2Q96QD8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms