Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms