Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPR78Q96P69 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms