Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY7

CLIC6, Chloride intracellular channel protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC6Q96NY7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIC6Q96NY7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLIC6Q96NY7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms