Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR9

ZNF560, Zinc finger protein 560, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF560Q96MR9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF560Q96MR9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF560Q96MR9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF560Q96MR9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF560Q96MR9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF560Q96MR9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF560Q96MR9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF560Q96MR9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF560Q96MR9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF560Q96MR9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF560Q96MR9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF560Q96MR9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF560Q96MR9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF560Q96MR9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF560Q96MR9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF560Q96MR9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF560Q96MR9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF560Q96MR9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF560Q96MR9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF560Q96MR9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF560Q96MR9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF560Q96MR9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF560Q96MR9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF560Q96MR9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF560Q96MR9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF560Q96MR9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF560Q96MR9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF560Q96MR9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF560Q96MR9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF560Q96MR9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF560Q96MR9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms