Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms