Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM47Q96LD4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM47Q96LD4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms