Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
USP47Q96K76 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
USP47Q96K76 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP47Q96K76 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP47Q96K76 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms