Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM87BQ96K49 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM87BQ96K49 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms