Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGBD1Q96JS3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms