Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCDC136Q96JN2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC136Q96JN2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 590.1 ms