Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC34Q96HJ3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms