Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPNQ96H22 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
CENPNQ96H22 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CENPNQ96H22 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CENPNQ96H22 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CENPNQ96H22 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CENPNQ96H22 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPNQ96H22 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPNQ96H22 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPNQ96H22 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPNQ96H22 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPNQ96H22 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPNQ96H22 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPNQ96H22 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPNQ96H22 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPNQ96H22 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms