Protein–RNA interactions for Protein: Q96GJ1

TRMT2B, tRNA (uracil(54)-C(5))-methyltransferase homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT2BQ96GJ1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRMT2BQ96GJ1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRMT2BQ96GJ1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRMT2BQ96GJ1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRMT2BQ96GJ1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRMT2BQ96GJ1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRMT2BQ96GJ1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRMT2BQ96GJ1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRMT2BQ96GJ1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRMT2BQ96GJ1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRMT2BQ96GJ1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRMT2BQ96GJ1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMT2BQ96GJ1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMT2BQ96GJ1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMT2BQ96GJ1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMT2BQ96GJ1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMT2BQ96GJ1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMT2BQ96GJ1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMT2BQ96GJ1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMT2BQ96GJ1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMT2BQ96GJ1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMT2BQ96GJ1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMT2BQ96GJ1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMT2BQ96GJ1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMT2BQ96GJ1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRMT2BQ96GJ1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRMT2BQ96GJ1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRMT2BQ96GJ1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRMT2BQ96GJ1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRMT2BQ96GJ1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRMT2BQ96GJ1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRMT2BQ96GJ1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRMT2BQ96GJ1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRMT2BQ96GJ1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRMT2BQ96GJ1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRMT2BQ96GJ1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRMT2BQ96GJ1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRMT2BQ96GJ1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRMT2BQ96GJ1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRMT2BQ96GJ1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRMT2BQ96GJ1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms